Неожиданно-стремительное нападение летающих шиноби Страны Неба на Коноху приводит к воистину потрясающему по своим масштабам разрушению. Коноха превращается в руины, большое количество шиноби-защитников пало, жертвы среди мирного населения перевалило за сотню. Ниндзя-медики не поспевают оказывать помощь всем раненым, да и их чакра небезгранична. Но появившийся в деревне старик смог оказать пострадавшим превосходную хирургическую помощь, чем немало изумил и порадовал утомленных медиков Конохи. Старик этот оказался прославленным Шинноу – врачом, о мастерстве и таланте которого слышали в самых разных уголках страны. Он и его ученик Амару направляются в деревню, что расположена на границе Страны Огня, дабы помочь их жителям. В спутники Шинноу-сенсею и Амару дают трех ниндзя: Сакуру, Хинату и Наруто, – которые обязаны защищать тех от разных опасностей. А их, опасностей, на пути будет предостаточно: непроходимые джунгли, где кишмя кишат ядовитые твари, шиноби-разведчики Страны Неба, невиданные демоны, и.. некто, кто знает все возможности Наруто назубок и потому может оказаться очень сильным противником. Но даже это не так пугает... Руины, которые находятся близ деревни – конечного пункта путешествия отряда, именно от них веет истинно большими неприятностями. Вот только бы знать.. какими?